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膽囊息肉包涵多種病變，對其處理有手術切除和非手術兩種，應區別對待。可結合息肉特點、症狀嚴重程度、病人全身情況(年齡、體質、主要臟器功能等)做出抉擇。一般說來，膽囊息肉要切除的指徵是：⑴息肉大於0.8~1.0cm，單發或位於膽囊頸部；⑵有明顯症狀或伴膽囊結石需手術者；⑶不除外腫瘤性息肉，尤其具有癌性危險信號；⑷隨診息肉迅速明顯長大或伴明顯症狀。
目前切除膽囊息肉有兩種方法。其一是保膽取出息肉，即切開膽囊取出息肉而保留膽囊，主要適用於息肉是良性病變，膽囊有功能者；其二是行膽囊切除術或微創腹腔鏡或開腹手術。
良性息肉切除後恢復良好，但惡性者其預後明顯受疾病的影響。現舉一例：該患者發現膽囊息肉，未定期去醫院隨診檢查。經過數年後複查息肉明顯長大，住院立刻手術，切除膽囊，但病理診斷膽囊癌。更不幸的是已轉移至多個鄰近腹腔臟器，已為癌症晚期，最終生命難以挽回。